天穗律师网法律顾问表示：专利合同纠纷是指当事人就专利权或者专利申请权的转让、专利实施许可、专利代理等事项所订立的合同而发生的纠纷。
专利合同纠纷：
(1)专利申请权转让合同纠纷
(2)专利权转让合同纠纷
(3)发明专利实施许可合同纠纷
(4)少实用新型专利实施许可合同纠纷
(5)外观设计专利实施许可合同纠纷
(6)专利代理合同纠纷
一、释义
专利合同纠纷是指当事人就专利权或者专利申请权的转让、专利实施许可、专利代理等事项所订立的合同而发生的纠纷。
专利申请权转让合同纠纷是指当事人就专利申请权的转让所订立的合同而发生的纠纷。
专利权转让合同纠纷是指当事人就专利权的转让所订立的合同而发生的纠纷。
发明专利实施许可合同纠纷是指当事人就发明专利权的实施许可所订立的合同而发生的纠纷。
实用新型专利实施许可合同纠纷是指当事人就实用新型专利权的实施许可所订立的合同而发生的纠纷。
外观设计专利实施许可合同纠纷是指当事人就外观设计专利权的实施许可所订立的合同而发生的纠纷。
专利代理合同纠纷是指专利代理机构作为受托人与委托人就办理专利申请或者办理其他专利事务所订立的合同而发生的纠纷。
二、管辖
由于合同标的物所涉专利权的特殊性，最高人民法院对专利合同纠纷管辖做出了特殊规定，即知识产权案件的受理必须遵守司法解释关于指定管辖和级别管辖的相关规定。最高人民法院《关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》第2条规定，各省、自治区、直辖市人民政府所在地的中级人民法院和最高人民法院指定的中级人民法院可以受理专利纠纷第一审案件。
另外，在确定专利合同纠纷案件的管辖时要注意，其中的专利权转让合同纠纷、专利申请权转让合同纠纷，应当作为专利纠纷案件由具有专利案件管辖权的中级人民法院受理；专利实施许可合同纠纷则应当按照最高人民法院《关于审理技术合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第43条第1、2款的规定确定管辖。专利代理合同纠纷案件的管辖，司法解释并未做出明确规定，鉴于其专业性较强，可以作为最高人民法院《关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》第1条第(16)项规定的“其他专利纠纷案件”，即由具有专利案件管辖权的中级人民法院受理为宜。
三、法律适用
处理此类纠纷的法律依据主要是最高人民法院《关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》。
与专利申请权和专利权转让合同相关的规定是《专利法》第10条和《专利法实施细则》，《合同法》第342条，最高人民法院《关于审理技术合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第22一24条，最高人民法院《关于贯彻执行<中华人民共和国民法通则>若干问题的意见(试行)》第137条。与专利实施许可合同相关的规定是《专利法》第1条、第47条、第54条和《专利法实施细则》，《合同法》第1章第3节，最高人民法院《关于审理技术合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第3部分。
与专利代理合同相关的规定是《专利法》第19条和《专利代理条例》。
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